IsoTag(同位素靶向糖蛋白質(zhì)組學(xué))是一個質(zhì)量非依賴型化學(xué)糖蛋白質(zhì)組學(xué)平臺,有助于解決完整糖蛋白質(zhì)組整體表征的獨特挑戰(zhàn)。在這種方法中,獨特的同位素特征專門嵌入到糖肽中,并用作計算上可識別的全掃描MS 報告基因。Carolyn Bertozzi 小組還開發(fā)了一種稱為同位素特征轉(zhuǎn)移和質(zhì)量模式預(yù)測(IsoStamp)的計算算法,用于檢測全掃描質(zhì)譜中的重編碼物質(zhì)。
具體產(chǎn)品的參數(shù)以收到產(chǎn)品說明書的參數(shù)為準(zhǔn)
雖然人們對分析完整的糖蛋白組非常感興趣,但糖蛋白形式(更廣泛地說,所有蛋白質(zhì)形式)的復(fù)雜性仍然難以完全定義。質(zhì)譜(MS)通常用于表征復(fù)雜的蛋白質(zhì)組學(xué)樣品。一種流行的蛋白質(zhì)鑒定策略是自下而上的鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)方法。在該方法中,對蛋白質(zhì)混合物進(jìn)行蛋白水解消化,通過LC分離所得肽并通過MS檢測,并從分配的肽序列推斷出它們的母體蛋白質(zhì)。
為了將從蛋白水解物中獲得的MS 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)鑒定,可以使用串聯(lián)MS來獲取單個肽段的序列信息,然后比較生物體蛋白質(zhì)組的計算機(jī)模擬蛋白水解物。通常,僅選擇豐度最高的肽段進(jìn)行碎裂(圖 2),而無法獲得相對少量的肽段的數(shù)據(jù)。鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)的一個固有問題是在濃度可跨越12個數(shù)量級的蛋白質(zhì)背景下鑒定低豐度蛋白質(zhì),例如疾病狀態(tài)的生物標(biāo)志物。
具體產(chǎn)品的參數(shù)以收到產(chǎn)品說明書的參數(shù)為準(zhǔn)
雖然人們對分析完整的糖蛋白組非常感興趣,但糖蛋白形式(更廣泛地說,所有蛋白質(zhì)形式)的復(fù)雜性仍然難以完全定義。質(zhì)譜(MS)通常用于表征復(fù)雜的蛋白質(zhì)組學(xué)樣品。一種流行的蛋白質(zhì)鑒定策略是自下而上的鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)方法。在該方法中,對蛋白質(zhì)混合物進(jìn)行蛋白水解消化,通過LC分離所得肽并通過MS檢測,并從分配的肽序列推斷出它們的母體蛋白質(zhì)。
為了將從蛋白水解物中獲得的MS 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)鑒定,可以使用串聯(lián)MS來獲取單個肽段的序列信息,然后比較生物體蛋白質(zhì)組的計算機(jī)模擬蛋白水解物。通常,僅選擇豐度最高的肽段進(jìn)行碎裂(圖 2),而無法獲得相對少量的肽段的數(shù)據(jù)。鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)的一個固有問題是在濃度可跨越12個數(shù)量級的蛋白質(zhì)背景下鑒定低豐度蛋白質(zhì),例如疾病狀態(tài)的生物標(biāo)志物。





